Pete e Myka capturam o Paracelsus, mas não antes de ele se tornar imortal. Quando o cancro de Myka piora, Pete tenta fazer um acordo com o Paracelsus para curar a sua colega. Enquanto isso, Claudia recebe novidades de Artie.
Quando Paracelsus assume o controlo do Warehouse 13, mostra que este é apenas o primeiro passo do seu plano para recriar todo o mundo à sua imagem. Para detê-lo Pete e myka devem segui-lo até ao ano 1541 e impedi-lo de matar os Regents e de se tornar o mestre das Warehouses.
Enquanto Pete e Myka formam equipa com dois ex-colegas dos Serviços Secretos para investigar uma série de mortes bizarras em Washington DC, Artie decide mostrar a Claudia como e porque é que a sua irmã tinha que desaparecer.
Enquanto Pete e Steven assistem a um perigoso incidente na feira renascentista, Myka concorda em ajudar Claudia a reavivar a memória da sua memória. Contudo descobrem que o seu ato tem consequências inesperadas para o armazém e para todos os presentes.
A ex-namorada de Pete, Kelly Hernandez pede-lhe ajuda para encontrar a sua avó desaparecida e o caminho leva-a a um drama sem sim. Enquanto isso, Artie obriga Claudia a ir com Steve para investigar o caso de um estudante universitário cuja coluna vertebral se partiu ao meio durante uma apresentação na sala de aula.
Valda de outra época entra em cena tornando Claire sua escrava. Enquanto o mesmo se prepara para mudar a Warehouse 13 para uma nova localização onde a possa controlar, a equipa corre desesperadamente para detê-lo antes que seja tarde demais.
Um misterioso homicídio no interior do bosque faz com que Nick e Hank reabram um caso encerrado sobre pessoas desaparecidas.
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